Секретариат является постоянно действующим рабочим органом ЕАГ. В своей деятельности Секретариат руководствуется Соглашением о ЕАГ от 16 июня 2011 года, Соглашением между Правительством Российской Федерации и Евразийской группой по противодействию легализации преступных доходов и финансированию терроризма об условиях пребывания ее на территории Российской Федерации от 14 февраля 2012, и Положением о Секретариате ЕАГ.
Секретариат формируется из числа граждан государств-членов ЕАГ.
Местом нахождения Секретариата является город Москва (Российская Федерация). Секретариат пользуется на территории Российской Федерации правами юридического лица.
Секретариат подотчетен Пленарному заседанию и выполняет следующие функции:
Секретариат осуществляет свою финансово-хозяйственную деятельность как самостоятельное юридическое лицо, имеет расчетные и иные счета в кредитных организациях, закрепленное за ним имущество, печать с полным наименованием и другие реквизиты самостоятельного учреждения.